Predicine Liquid Biopsy превосходит четыре других ведущих NGS-теста ctDNA в исследовании, проведенном Bristol Myers Squibb

Predicine, глобальная компания, занимающаяся исследованиями в области молекулярной медицины,  объявила о результатах нового исследования, которое продемонстрировало превосходную эффективность анализа жидкой биопсии нового поколения (NGS) PredicineATLAS по сравнению с четырьмя другими ведущими анализами жидкой биопсии по ключевым показателям. Рукопись «Прямое сравнение анализов секвенирования циркулирующей опухолевой ДНК с целевыми большими генными панелями» была опубликована в Интернете до публикации в PLOS ONE.

Параллельное исследование проводилось под руководством группы ученых Bristol Myers Squibb (BMS), которые оценили пять ведущих анализов NGS с большой панелью генов циркулирующей опухолевой ДНК (цДНК). Идентичные слепые эталонные панели, имитирующие клинические бесклеточные образцы ДНК, поставлялись каждому поставщику и тестировались им. Полученные данные были обобщены и переданы ученым BMS, которые выполнили подробный непредвзятый анализ производительности каждого анализа.

Исследование показало, что по ключевым показателям, включая чувствительность обнаружения, специфичность, точность и воспроизводимость, PredicineATLAS с 600 генами (называемый в исследовании «Анализ B») превзошел все другие протестированные тесты. Например, при низком уровне ввода ДНК (10 нг) PredicineATLAS обеспечивает самую высокую чувствительность среди всех анализов.

Кроме того, PredicineATLAS продемонстрировал 100% специфичность (т.е. отсутствие ложноположительных результатов). С точки зрения точности PredicineATLAS наиболее точно отражает ожидаемую долю мутаций, особенно на низком уровне (0,125%), обеспечивая самую высокую точность среди пяти протестированных анализов. Следует отметить, что в исследовании также сообщается, что PredicineATLAS не только продемонстрировал самую высокую медианную глубину покрытия при низком уровне ввода ДНК (10 нг), но и самую высокую скорость фильтрации фонового шума. подчеркивая надежность рабочего процесса Predicine NGS и конвейера биоинформатики. Кроме того, анализ Predicine был также единственной платформой жидкой биопсии, рассмотренной в исследовании, способной обнаруживать делецию гена или снижение числа копий (CNR).

В документе подчеркивается, что «Анализ B устранил более 95% фонового шума с помощью своего биоинформатического конвейера без использования образца ДНК зародышевой линии в качестве контроля. Это впечатляет, учитывая, что анализ B также показал самую высокую чувствительность среди пяти анализов».

«Испытания жидкой биопсии с большими генными панелями не подвергались систематической оценке с помощью прямых сравнительных исследований», — сказал д-р Массимо Кристофанилли, директор отделения медицинской онкологии молочной железы и заместитель директора по прецизионной онкологии в Онкологическом центре Сандры и Эдварда Мейер в Weill Cornell Medicine, который не участвовал в этом исследовании. «Это исследование показывает, что, хотя все технологии демонстрируют сопоставимую чувствительность, возникают некоторые различия. Я считаю, что результаты этого исследования очень информативны и обеспечивают желаемую основу для оценки и выбора подходящих платформ анализа жидкой биопсии для клинического внедрения, включая тестирование пациентов, клинические испытания и разработку сопутствующей диагностики (CDx)».

Поделиться

Источник