PacBio анонсирует новые системы секвенирования, Revio и Onso
Американская компания по секвенированию генов Pacific Biosciences of California (PacBio) представила новую систему секвенирования, получившую название Revio, и объявила о внешнем бета-тестировании своей системы секвенирования Onso.
Revio — это система секвенирования с длительным чтением, которая позволяет клиентам секвенировать до 1300 полных геномов человека в год с 30-кратным охватом менее чем за 1000 долларов США за геном.
Система позволяет масштабировать использование технологии секвенирования PacBio HiFi для крупных исследований в области генетики человека, исследований рака и сельскохозяйственной геномики, среди прочего.
Revio станет первой системой компании, оснащенной усовершенствованными графическими процессорами NVIDIA, которые обеспечивают 20-кратное увеличение вычислительной мощности по сравнению с системой секвенирования Sequel IIe.
В дополнение к высокой пропускной способности вычислительная система с поддержкой искусственного интеллекта будет интегрировать алгоритмы глубокого обучения для обнаружения метилирования ДНК и Deep Consensus для улучшения секвенирования HiFi, заявили в компании .
Президент и главный исполнительный директор PacBio Кристиан Генри сказал: «Наши клиенты изменили геномику с помощью секвенирования HiFi. Revio еще больше раскроет эту мощь, добавив высокую пропускную способность и доступность.Мы разработали совершенно новую ячейку SMRT с плотностью в три раза выше, чем наша существующая ячейка SMRT 8M, в результате чего получается 25 миллионов ZMW. Revio будет запускать до четырех ячеек SMRT параллельно, что обеспечивает до 100 миллионов ZMW для одновременного секвенирования отдельных молекул.В сочетании со значительными достижениями в наших вычислениях Revio обеспечит более короткое время работы и 15-кратное увеличение данных HiFi. Я очень рад видеть, что исследователи могут открыть, используя мощь Revio».
Onso — это настольная платформа для секвенирования ДНК с коротким считыванием, которая использует технологию секвенирования PacBio путем связывания (SBB) для обеспечения высочайшего уровня точности.
PacBio выбрала три площадки для бета-тестирования Onso, в том числе Broad Institute of MIT и Harvard, Corteva Agriscience и Weill Cornell Medicine.Бета-тестирование предназначено для того, чтобы помочь ученым протестировать спецификации Onso и предоставить PacBio критические отзывы.
После завершения бета-программы компания начнет принимать заказы на Onso в первом квартале 2023 года, а поставки начнутся в первой половине 2023 года.
Генри сказал: «Мы рады видеть, как исследователи будут использовать новаторскую точность секвенирования, которую, как мы ожидаем, обеспечит Onso.После запуска мы ожидаем, что станем единственной известной нам компанией, предлагающей как высокоточные собственные технологии короткого, так и длительного секвенирования, что позволит нам предлагать более полные решения задач наших клиентов. Onso предназначен для обеспечения высокоточных считываний секвенирования, поддержки масштабируемой, гибкой и оптимизированной по стоимости работы, а также позволяет клиентам чувствовать себя более уверенно в своей науке».
Поделиться
Источник