Oxford Nanopore открывает рынок геномики с PromethION 2 Solo: первым в мире портативным высокопроизводительным секвенсором, обеспечивающим комплексный анализ ДНК для всех и везде

blank

Компания Oxford Nanopore Technologies   объявляет о выпуске секвенатора PromethION 2 («P2») Solo, самого доступного в мире высокопроизводительного устройства для секвенирования, способного значительно расширить доступ к точному, быстрому и недорогому секвенированию. для генетики человека и других более крупных наборов данных.

Устройство P2 Solo со стартовым пакетом стоимостью 10 455 долларов США является единственным небольшим высокопроизводительным секвенсором на рынке — по размеру он эквивалентен одному печатному тому трилогии «Властелин колец». Это позволит любому выйти за рамки базового анализа ДНК, включив более полный анализ генетических вариантов, транскриптомный и эпигенетический анализы на единой платформе, чтобы способствовать научным открытиям и улучшать жизнь.

Основываясь на продемонстрированной ценности платформы PromethION, устройство использует высокоточное секвенирование нанопор любой длины нативных прочтений (от 20 оснований до более чем 4 миллионов оснований) и фиксирует полную биологию, включая SNP, INDEL, структурные варианты и метилирование из одинарная проточная ячейка.

Это разработано, чтобы открыть рынок геномики, снабдив любого и в любом месте высокопроизводительными данными секвенирования всего генома в режиме реального времени:

  • Новое устройство P2 Solo даст пользователям возможность использовать технологию секвенирования нанопор для комплексного секвенирования до 190-380 геномов человека в год в их собственных лабораториях. С помощью PromethION 48 («P48») пользователи могут масштабировать примерно до 4600–9200 геномов человека в год. Цифры указаны как 1-2 генома на проточную ячейку.
  • Благодаря уникальной модели «box is free», предлагаемой Oxford Nanopore, это позволяет пользователям создавать всесторонние геномы человека в собственной лаборатории менее чем за 1000 долларов с помощью P2 или, при работе в производственном режиме с устройствами P48, достигать стоимости генома примерно От 300 до 600 долларов США (при 1–2 геномах человека на проточную кювету, простая подготовка библиотеки стоит от 43 долларов США за геном, без дополнительных затрат на устройство, метилирование и фрагменты любой длины) с будущим путем дальнейшего сокращения.
  • Размер и функциональность P2 Solo сочетаются с его исключительной точностью, сочетая новейшие проточные кюветы R10.4.1 с новейшим набором 14 для предоставления данных секвенирования, которые обеспечивают точность модального необработанного симплекса 99,6% (Q24) и дуплекса одной молекулы. точность 99,92 % (Q31) с настраиваемыми условиями работы для большей гибкости и оптимизации.
  • В ранней программе небольшой тестовой группы «разработчиков» P2 Solo уже использовался для анализа образцов для исследования рака. Секвенирование с помощью нанопор сочетает в себе возможность генерировать длинные считывания секвенирования (до 4 Мб), которые могут охватывать сложные области генома, вместе с интегрированным обнаружением модификации оснований (включая метилирование ДНК/РНК) и получением результатов в режиме реального времени. Это предлагает полное, оптимизированное и быстрое решение для всесторонней характеристики образцов рака.
  • Выпуск P2 Solo сопровождается полным рабочим процессом генома в EPI2ME, решении для анализа данных Oxford Nanopore, позволяющем пользователям просто загружать свои файлы и получать отчеты о небольших вариантах, структурных вариантах и ​​метилировании простым щелчком мыши.

PromethION 2, полностью готовый к работе настольный секвенатор нанопор от Oxford Nanopore из той же линейки, что и P2 Solo, содержит мощный графический процессор и работает с двумя высокоэффективными проточными ячейками PromethION. Он доступен для предварительного заказа и будет доступен для отгрузки в ближайшие месяцы.

Серия PromethION была разработана для сведения к минимуму негативного воздействия на окружающую среду за счет дальнейшей интеграции устойчивого развития в дизайн продукта, производственные процессы и повседневную деятельность.

Поделиться

Источник