Новый метод секвенирования, разработанный в IOB, может стать универсальным инструментом выбора

Секвенирование одноклеточной РНК (scRNA-seq) показывает, какие гены включены в клетке и каков уровень их транскрипции. Это позволяет проводить углубленную оценку биологии отдельных клеток и обнаруживать изменения, которые могут свидетельствовать о заболевании. scRNA-seq находит широкое применение в различных дисциплинах, включая биологию развития, неврологию, онкологию, иммунологию, исследования сердечно-сосудистой системы и инфекционные заболевания.

Это имеет решающее значение для изучения неоднородности популяции, выявления представляющих интерес субпопуляций меньшинств и для обнаружения уникальных характеристик отдельных клеток. Область применения выходит далеко за рамки офтальмологии: секвенирование отдельных клеток широко используется для анализа мутаций зародышевой линии de novo и соматических мутаций в нормальных и больных клетках, например, в раковых клетках.

Новый протокол scRNA-seq, разработанный в IOB совместно с учеными из Института биомедицинских исследований Novartis, может использоваться для изучения любой модели заболевания, требующей анализа популяций редких клеток с высоким разрешением.

Симона Пичелли, руководитель платформы IOB Single-Cell Genomics и старший автор статьи, объясняет: «Наш модульный протокол FLASH-seq обеспечивает моментальный снимок клеточного транскриптома с беспрецедентным разрешением. Метод можно миниатюризировать, автоматизировать и адаптировать к различным потребностям. Это помогает определить, какие изоформы генов присутствуют в норме и болезни. Он также дает гораздо более глубокую картину экспрессии генов, особенно после нарушений, вызванных болезнью, дефектами развития или внешними факторами. Кроме того, его легко настроить в лаборатории.«

Новый метод может генерировать готовые к секвенированию библиотеки всего за полдня. Поэтому исследователи из IOB считают, что FLASH-seq может стать предпочтительным инструментом при поиске эффективного, надежного, модульного, доступного и удобного для автоматизации полноразмерного протокола scRNA-seq.

Поделиться

Источник